El proyecto de restauración de la Casa de María Josefa Ezcurra tiene en cuenta los planos de obras sanitarias realizados en el año 1893, documentación de diverso origen existente en archivos de la ciudad, como planos de obras sanitarias y relevamientos anteriores.

La puesta en valor sigue el criterio de recuperar al máximo la arquitectura de la época en que su dueña habitara la casa, para lo cual es necesario mantener los cambios que sufrió a través de los años y que forman parte de la memoria colectiva de varias generaciones. En el trabajo preliminar realizado en la casa, se efectuaron tareas de investigación arqueológica que permiten conocer parte de la historia anterior y dejan entrever las formas de vida cotidianas del período investigado.

Las excavaciones realizadas en el segundo patio de la vivienda dieron como resultado la aparición de cisternas de agua y un pozo de basura. Se encontraron materiales de diversa índole y antigüedad, como trozos de loza, vidrio y tela, que una vez restaurada la casa, serán expuestos en una sala ubicada en el sector del antiguo pozo de basura. Los pozos de basura y de agua serán conservados y quedarán a la vista del público. El pozo de agua se complementará con un aljibe de mármol que se corresponde con la época de su construcción, aunque no haya pertenecido a la casa.

En los muros se hicieron tareas de cateo y se descubrieron puertas con sus correspondientes carpinterías originales, que estaban tapiadas con mampostería, además se realizó un estudio estratigráfico, observando las distintas capas de pintura a la cal que cubren las paredes. Los ladrillos de los sectores demolidos, vigas e madera, herrajes y clavos, se guardaron para ser reutilizados. El estudio de sus dimensiones permite establecer la edad del muro de donde provienen.

En el edificio de la Casa de Juan Bautista de Elorriaga también se realizaron cateos en los muros para evaluar su estado y antigüedad. Los trabajos de restauración se continúan y en la PB se abrirá próximamente un restaurante, uso tradicional del local, se recreará una panadería de los años 1930 con los muebles originales, se instalará la tienda del museo, etc. Concluida en su totalidad la restauración y puesta en valor, las distintas salas se destinarán a exhibir las colecciones del Museo de la Ciudad.